《中国好歌曲》后期歌曲改编环节引发了一定的争议，刘欢老师表示很是吃惊，也包含着几重惊喜：“什么时候所有人都开始关注歌曲的改编了”？第二季《好歌曲》的模式会进一步升级，目前已经确定学员不会从头至尾只唱一首歌曲，求做公司歌曲改编环节是否保留还在讨论。但导师们都表示，有改编就会有争议，这很正常。
周华健以自己过去做唱片的经历来看，改编歌曲总是一直困扰着歌手，时常会因为某些因素添加一些内容，或者改变风格。蔡健雅也非常赞同这一点：“编曲就是见仁见智，每个人对音乐的喜好、接受度和听歌的范围都不一样。”
求做公司歌曲伴奏配乐：台湾的唱作人苏珮卿的作品《格格不入》，此前令人最印象深刻的是她的竖琴演奏，这一次，她的外国老公陪伴着她走上了舞台，坐在她身边，为她以木箱鼓伴奏；16岁的涂议嘉希望在自己的《蒲公英在飞》加入格里高利圣咏元素，刘欢和捞仔就帮她重新编曲，把这首《蒲公英在飞》打造成了弦乐演奏和哥特式摇滚的结合体。
呈现的音乐效果仿佛带观众穿越回了中世纪的宫廷；满族唱作人乌拉多恩的《鸟人》极具异域风情，为了把它打造成世界音乐的风格，捞仔最终选择了印度的西塔琴和塔不拉鼓作为配器，为了找到两件乐器，节目组甚至求助了印度大使馆。
求做公司歌曲非每首歌曲的改编都能获得认可。比如霍尊的《卷珠帘》，在二次呈现中，这首歌不但改变了歌词，而且加入了琵琶、箫、提琴、木吉他、大鼓等配器，有人因此质疑，这种改编过于隆重，掩盖了歌曲原有的素雅和凄美。对此，刘欢解释称，之所以敢于大刀阔斧地帮《卷珠帘》进行更宏大的编曲调整，是出于对霍尊演唱能力的信任：“如果唱作人的演唱能力有限，我会比较小心，但对霍尊我很有信心”。
